Первыми экспонатами музея были экспонаты естественно-исторического характера. Основой создания музея стала необычная находка в 1887 году инородца Чечуйского наслега Вилюйского округа Семена Егорова. Это был череп с рогами доисторического ископаемого бизона, уважительно названного «дедушкой музея». Сегодня эта находка стала символом музея.
Самая первая экспозиция музея представляла собой выставку коллекций, собранных со всей территории Якутского округа, в том числе, представители ископаемого царства – 450 экз., по этнографии – 120 экз., по антропологии – 4 экз., животные – 120 экз., растения – 150 видов, насекомые – 400 и палеонтологические – 80 экз. В фондах отдела природы хранятся сборы политссыльных: Виташевского Н.А., Оленина П.В., Ионова, Драверта, М.И.Губельмана.
Огромная заслуга политссыльного М.И.Губельмана (Ем. Ярославского) в развитии обогащении, систематизации коллекций музея. За время работы заведующим музеем он значительно пополнил коллекции. В 1916 году одним из наиболее систематизированных отделом стал отдел зоологии, в котором имелись богатые коллекции (5000 экз.), птиц (343 экз.), рыб (111 экз.), земноводных (42 экз.), пресмыкающихся (8 экз.). В отделе ботаники имелись коллекции из 2000 гербарных листов и около 4000 гербарных экземпляров растений, ожидающих обработки.
В 1925 году Якутская комиссия Академии наук СССР, руководившая организацией и работой многочисленных экспедиций в 1925-1930 г.г., взяла на себя шефство над Якутским областным музеем им. Ем. Ярославского. В 1926 г. по рекомендации Комиссии были командированы: на должность заведующего музеем – этнограф М. М. Измайлова, препаратора – сотрудник академической экспедиции М. А. Габшевич, в 1927 г. в музей пришли сотрудник Зоологического музея К. Е. Воробьева и заведующий академической базой в г. Якутске В. М. Чистов. В марте 1925 года для пополнения коллекций музея была организована Вилюйская зоолого-ботаническая экспедиция под руководством К.Е.Воробьевой.
В настоящее время коллекция отдела природы состоит из:
– зоологической коллекции. В эту коллекцию входят редкие птицы, занесенные в Красную Книгу (стерхи, фламинго, розовая чайка, отдельные виды гагар, птенец черного журавля), млекопитающие – чучела отдельных видов животных, редко встречающихся на территории Якутии или занесенных в Красную Книгу (амурский тигр, речная выдра);
– энтомологической – коллекции насекомых;
– палеонтологической – ископаемые останки доисторических животных;
– ботанической – гербарийный материал, состоящий из дара Российской АН, сборов исследователей, участников Северных экспедиций Н.А. Виташевского, П. Драверта, П. Оленина и др., экспедиций ботанического отряда музея;
– геологической – коллекции горных пород и минералов.
Современная экспозиция отдела природа построена по принципу природно- географического зонирования. Основная идея экспозиции отдела природы – осознание человеком единства и взаимосвязи с северной природой, своей значимости в обществе. Представители фауны и флоры основных природных зон представлены в диорамах «Арктическая и субарктическая пустыни», «Тундра», «Верхоянский хребет», «Алданское нагорье», «Центральноякутская равнина». Плейстоценовая фауна представлена в отдельном зале.
Заведующая сектором природы – Кондакова Нелли Гавриловна
Методист по музейно-образовательной деятельности – Бочкарев Владимир Владимирович
e-mail: museum1887@mail.ru